Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms