Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMP2P13473 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms