Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms