Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms