Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms