Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms