Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRB1P04280 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRB1P04280 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRB1P04280 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRB1P04280 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRB1P04280 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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