Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms