Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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