Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CCNDBP1O95273 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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