Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKAP2O75563 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKAP2O75563 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SKAP2O75563 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKAP2O75563 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKAP2O75563 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKAP2O75563 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SKAP2O75563 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms