Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms