Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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