Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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