Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF10AO00220 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms