Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms