Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms