Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms