Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms