Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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