Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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