Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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