Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms