Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms