Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms