Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA3Q9UI47 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms