Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms