Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms