Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms