Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC17Q9NVM6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms