Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms