Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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