Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms