Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms