Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms