Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms