Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms