Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms