Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms