Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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