Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms