Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms