Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms