Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms