Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms