Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms