Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBA3Q8TBC4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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