Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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