Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC33Q8N5R6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms