Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms